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[科技] DNA

DNA

最新研究顯示,人類基因組超過 75% 是「垃圾 DNA」
https://tomorrowsci.com/science/%E6%9C%80%E6%96%B0-%E7%A0%94%E7%A9%B6-%E9%A1%AF%E7%A4%BA-%E4%BA%BA%E9%A1%9E-%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%B5%84-%E8%B6%85%E9%81%8E-75-%E5%9E%83%E5%9C%BEdna/

2012年,DNA 元素百科全書(the Encyclopedia of DNA Elements,ENCODE)公布,人類基因組中 80% 的序列具有生化功能。然而,美國休斯頓大學的進化生物學家 Dan Graur 在新發表的論文中稱,人類基因組序列中很可能只有 10%-15% 的基因具有功能,至多不會超過 25%。基因組中其餘的序列,都是無用及無害的垃圾 DNA(junk DNA)。

功能性基因和有害突變人類基因組中的功能性部分指的是具有選擇效應(selected-effect)的序列,即在進化中,該序列功能出現後經歷了自然選擇並被保留下來。蛋白質編碼基因、RNA 指定基因和 DNA 受體基因都屬於此類基因。
在 Graur 教授的模型中,只有基因組中的功能性部分才會被有害突變(deleterious mutations)損害;如果有害突變發生在非功能性部分,其作用是中性的,因為這部分DNA序列既不會被損害,功能也不會被提高。
替換生育率Graur 教授的計算方法,就用到了有害突變發生的機率,以及替換生育率(replacement fertility rate)。
簡單來說,假設人類基因組保持不變,父母的基因通過生殖細胞完美地複製到子女,那麼每對夫婦只要生育兩個小孩,就可以保持人口數量不變。但自然情況下,由於有害突變,每對夫婦生育的後代數量必須大於 2,人口數量才會保持不變。這一過程中,每對夫妻生育的後代數量,就是替換生育率。


全球人口數字。進化生物學家 Dan Graur 認為,人類具有功能的基因比率越高,人類人口越難增長。研究結果有了這兩個概念,再加上之前確定的基因組大小和功能性部分的有害突變率,以及人口數量的歷史數據,Graur 計算了由有害突變引起的生育下降,即「突變負荷」(mutational load)的數據。
Graur 說,在過去的 20 萬年中,替換生育率維持在每對夫婦 2.1-3.0 個孩子,全球人口數量保持穩定。直到 19 世紀初,新生兒死亡率顯著下降,人類的生育率開始超過替換水平。
Graur 的模型發現,隨著基因組功能性部分佔比增加,基因發生有害突變的機率亦隨之增加,導致替換生育率顯著增高。如果人類基因組中 80% 是功能性部分,即使有害突變率降到最低,每對夫婦要生育的後代數也將高得離譜:15 個後代,其中兩個還得死亡或不育。如果用最高的有害突變率(2*10e(-8))進行模擬,結果更令人咋舌:維持人口數量不變的替換生育率是可觀測宇宙內恆星數目的十倍之多!
基於這一計算,Graur 推斷基因組功能性部分的比例為 10%-15%,上限為 25%。
我們推薦:
全球首宗以 CRISPR 修改活胚胎基因的結果出爐

意義與評價這項研究的計算方法畢竟有些簡單。Graur 希望,他們的成果可以幫助大家重新審視人類基因組的科學研究。我們需要了解其中的功能性部分,才能集中進行預防和治療疾病的生物醫學研究:「我們只要能分辨具有功能的 DNA 和垃圾 DNA,便沒有必要弄明白所有序列,只需要測定我們確認具有功能的那一部分即可。」
五姑婆

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【動畫】
扮小丑殺「情敵」搶人夫 DNA破27年懸案
http://hk.apple.nextmedia.com/international/art/20170930/20168918

DNA表型技術
http://www.forum4hk.com/viewthread.php?tid=34805&highlight=DNA

DNA變電腦 儲存數據資訊
http://www.forum4hk.com/viewthread.php?tid=27321&highlight=DNA

「垃圾DNA」八成有妙用
http://www.forum4hk.com/viewthread.php?tid=28735&highlight=DNA

[ 本帖最後由 Anonymous 於 2017-9-29 05:56 編輯 ]
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連環姦殺犯30年後落網 
FBI藉DNA尋親網緝兇惹爭議
https://hk.news.appledaily.com/international/daily/article/20180429/20375960?_ga=2.216530390.1756366832.1525000187-1243896394.1525000187

【全球僅100例‧有片】美國女模擁2膚色2組DNA:一個人的雙胞胎
http://www.orangenews.hk/news/system/2018/05/10/010088937.shtml

中國申請人親子移民 驗DNA揭逾兩成造假
http://www.mingpaocanada.com/van/htm/News/20180509/vaa1h_r.htm

[ 本帖最後由 KT66 於 2018-5-10 08:01 編輯 ]
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KT88

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36%瀕危植物難冷藏留種
http://orientaldaily.on.cc/cnt/china_world/20181104/00180_026.html

千禧世代之初,科學家開始冷藏罕有和具經濟價值的植物種子,以便一旦地球嚴重氣候轉變時,仍可為未來一代恢復環境與植被。不過,有英國研究指不少種子無法抵受現時的冷藏法,直言於二○二○年前儲存七成五受威脅植物種子的計劃,是近乎不可能。

不死也變短命
人類的發展持續損害自然生態,國際科學家於二○○二年起逐步儲存稀有的植物種子。然而,英國皇家植物園的植物學家於上周五指出,有三成六瀕危植物無法在現時的「先弄乾後冷藏」的儲存法存活,可可豆、橡樹、牛油果等重要植物種子,均會在乾燥下死亡。

皇家植物園負責人迪基(John Dickie)指就算能夠抵禦冷凍儲存,其中兩成種子事後亦難以生長或壽命變短。他提出用液態氮極低溫急凍種子,避過弄乾的過程,或能提高種子的存活率。迪基認為當務之急是盡快確認偏遠和熱帶地區有哪些植物瀕臨絕種,盡可能加以保育及儲存。

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【AIDS免疫】中國首誕「基因改造」孖女惹爭議 廣東衞健委介入調查
https://hk.news.appledaily.com/china/realtime/article/20181126/58959952

美聯社今日報道,一名來自深圳的科學家賀建奎接受訪問時宣稱,內地一對經過基因改造技術的雙胞胎女嬰在本月出生,天生就對愛滋病有免疫力,成為全球首宗人類基因改造案例。外媒報道指,如果消息屬實,將會引發科學和醫學道德倫理上的大躍進,但做法卻引起不少外國科學家質疑,認為這會演變成大問題。賀建奎將於明天(27日)於香港大學舉行的第二屆人類基因組編輯國際峯會中,公佈研究成果。
最新消息指,廣東省衞生健康委員會已針對此事展開調查,並將及時公佈結果。
據內媒報道,賀建奎是南方科技大學生物系副教授。由於有關研究曝光後引發各界爭議,內地媒體紛紛嘗試向南方科技大學核實情況。據《證券時報》最新消息,有不願具名的業內人士透露,南方科技大學校長陳十一在一個行業群組中,對基因編輯嬰兒事件作出回應:「這個跟南科大無關,研究不在南科大,研究人員停薪留職中。」
南方科技大學隨後發佈聲明,指賀建奎已於2018年2月1日停薪留職,離職期為2018年2月至2021年1月。而根據目前了解到的情況,此項研究工作為賀在校外開展,未向學校和所在生物系報告,學校和生物系對此不知情。對於賀將基因編輯技術用於人體胚胎研究,生物系學術委員會認為其嚴重違背了學術倫理和學術規範。南方科技大學將立即聘請權威專家成立獨立委員會,進行深入調查,待調查之後公佈相關訊息。
此外,「知識分子」微博發佈中國122名科學家的聯合聲明,指這項所謂研究的生物醫學倫理審查形同虛設;直接進行人體實驗,只能用瘋狂形容;作為生物醫學科研工作者,堅決反對!強烈譴責!據公開資料顯示,「知識分子」是由北京大學神經生物學家饒毅、清華大學神經生物學家魯白、普林斯頓大學及北京大學教授謝宇3位學者在2015年創辦。
美聯社引述一名在中國參與工作的美國科學家透露,這類基因改造技術在美國禁止施行,認為改變基因有可能遺傳下一代,以及對其他基因造成傷害。西方主流科學家更提出質疑,認為這做法不安全,並讉責中國根本是在進行人體實驗。
賀建奎向美聯社透露:「我感到有責任,不僅做第一個,也要做個榜樣。社會將決定下一步該做甚麼。」他指曾培養7對受孕胚胎,最終只有一對成孕;但他拒絕透露該對雙胞胎的父母身份,也沒有在任何醫學期刊發表研究成果。
內地傳媒報道,賀建奎在公開的影片中,以英語介紹這對名為露露及娜娜的雙胞胎女嬰,數星期前健康出世。他說,母親以傳統人工授孕,科學家在卵子受精、仍未開始分裂時,加入一些蛋白質和指引信號進行基因手術,關閉愛滋病的感染渠道,雙胞胎出生後擁有天然抵禦愛滋病毒感染的能力。
賀建奎即將在峯會中展示在老鼠、猴和人類胚胎的實驗數據。在50個人類胚胎基因排序結果顯示,未發現脫靶情況;而所有人類正常胚胎中,有超過44% 的胚胎基因改造有效。賀建奎還展示此次基因手術嬰兒臍帶血的檢測結果,證明基因手術成功,並未發現脫靶情況。他表示,結果仍然需要時間觀察與檢驗,因此準備了長達18年的隨訪計劃。
美國賓夕法尼亞州大學基因編輯專家、《遺傳學》編輯Kiran Musunuru博士批評,這是對人類道德上不合情理的實驗。美國加州斯克里普斯研究所(Scripps)負責人托波爾博士(Eric Topol)也指出,賀建奎的做法太不成熟,對人類進行基因改造是一個大問題。不過,哈佛大學的遺傳學教授丘奇(George Church)認為,因為不斷增加的公共衞生威脅,用基因改造讓嬰兒免於愛滋病是合理的。
北京大學醫學部免疫學系教授王月丹引述生物醫學權威期刊《自然醫學》(Nature Medicine)的一項研究稱,接受基因改造治療後,患者體內有較大可能形成惡性腫瘤。不過,現有的研究只是「初步結果」,尚不清楚這些發現最終是否會在臨床研究中體現出來。
香港大學李嘉誠醫學院愛滋病研究所所長陳志偉向內媒回應:「對沒有科學論文正式發表的消息,是不應該胡亂宣傳,更無法點評的。」但就健康胚胎進行基因改造,他認為:「這是不理智的,不倫理的。」
清華大學愛滋病綜合研究中心常務副主任張林琦說:「這事件已經遠遠超出了技術問題的範疇,後果不可預測,一定是倫理爭論的焦點。即使技術是100%可靠,人類是否可以或應該編輯自己的生殖細胞和胚胎,(看到這個消息)絕大多數人肯定大腦一片空白,包括我自己。」

【AIDS免疫】涉事醫院前主任驚爆:倫理審查申請書或造假
https://hk.news.appledaily.com/china/realtime/article/20181126/58961508

[ 本帖最後由 ChairmanMao 於 2018-11-26 08:41 編輯 ]

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全球首例免疫愛滋基因編輯嬰兒中國誕生 百科學家聯署叫停 譴責嚴重違背學術倫理規範
https://hk.news.yahoo.com/%E5%85%A8%E7%90%83%E9%A6%96%E4%BE%8B%E5%85%8D%E7%96%AB%E6%84%9B%E6%BB%8B%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%B7%A8%E8%BC%AF%E5%AC%B0%E5%85%92%E4%B8%AD%E5%9C%8B%E8%AA%95%E7%94%9F-%E7%99%BE%E7%A7%91%E5%AD%B8%E5%AE%B6%E8%81%AF%E7%BD%B2%E5%8F%AB%E5%81%9C-%E8%AD%B4%E8%B2%AC%E5%9A%B4%E9%87%8D%E9%81%95%E8%83%8C%E5%AD%B8%E8%A1%93%E5%80%AB%E7%90%86%E8%A6%8F%E7%AF%84-142658614.html

【基因編輯嬰兒●最新】未現身港學術峰會 賀建奎急退房行蹤未明
https://hk.news.appledaily.com/local/realtime/article/20181127/58963021

深圳科學家:全球首製抗愛滋孖胎
中外學者譴責瘋狂
https://hk.news.appledaily.com/local/daily/article/20181127/20555737

基因編輯涉科學倫理危機
https://hk.news.appledaily.com/local/daily/article/20181127/20555741

本港20至29歲愛滋病個案微升 醫生籲勿諱疾忌醫:藥物可防發病
https://hk.news.appledaily.com/local/realtime/article/20181127/58963572

【基因編輯嬰兒】「內地DNA測序技術與歐美同步」 賀建奎想做中國愛因斯坦
https://hk.news.appledaily.com/china/realtime/article/20181127/58964470

【基因改造嬰】涉事醫院稱無負責接生:不認識賀建奎 質疑有人造假已報警 (17:09)
https://news.mingpao.com/ins/instantnews/web_tc/article/20181127/s00004/1543308268747

【基因編輯嬰兒】實驗同意書曝光 每對夫婦收$31萬
https://hk.news.appledaily.com/china/realtime/article/20181127/58965516

[ 本帖最後由 WeAreHK 於 2018-11-27 22:08 編輯 ]
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基因編輯孖女已出生 賀建奎:我用下半生負責
https://hk.on.cc/hk/bkn/cnt/news/20181128/bkn-20181128134503734-1128_00822_001.html

【基因編輯嬰兒】內幕消息:賀建奎被「軟禁」 實驗團隊有哈佛教授
https://hk.news.appledaily.com/china/realtime/article/20181201/58981489

內地科學家賀建奎,近日因宣稱經基因編輯,令一對先天對愛滋病免疫的孖女在中國出生,掀起軒然大波。來自深圳南方科技大學(簡稱南科大)的內幕消息指,賀建奎於11月28日在香港出席第二屆人類基因組編輯國際峯會後,南科大校長陳十一親自出馬,來港將他帶回深圳,賀建奎現已被校方「軟禁」。

消息指,陳十一與賀建奎進行了6小時面對面會談後,知悉了基因編輯嬰兒的全部詳情。事件由幾位國內外生命科學專家互相勾結,是一宗有意逃避西方法律、學術法規與監管制度而進行的人體胚胎基因編輯試驗。  

至於為甚麼要選擇中國作為試驗地?消息稱:「就是看中了中國的法律漏洞和賀建奎這個大傻瓜!」消息還透露,研究的參與者有賀建奎在萊斯大學的博士論文指導老師Michael Deem,以及他在史丹福大學的博士後導師;團體中甚至包括哈佛大學的教授。賀建奎更於去年底,親自去了哈佛大學,向團隊中的哈佛教授匯報實驗進度。


而基因編輯嬰兒的主要資金來源,是以「瀚海基因測試儀公司」的名義募集的社會融資,約有2億多人民幣(約2.2億港元);這些利益集團在幕後操縱這場基因編輯實驗。消息還稱,南科大即將就事件發佈正式公告。  

《蘋果》記者前日亦在南科大目擊,南科大校區警衞森嚴,門外有警車直驅校園,疑似調查今次事件。

曾與賀建奎交流 史丹福查校內學者
http://orientaldaily.on.cc/cnt/china_world/20190209/00178_002.html

[ 本帖最後由 WeAreHK 於 2019-2-9 01:19 編輯 ]
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【天網恢恢】兩少女遭轟頭殺害20年 兇手親友上載DNA資料意外破懸案
https://hk.news.appledaily.com/international/realtime/article/20190319/59381905
成吉思汗 鐵木真(ᠴᠢᠩᠭᠢᠰ; ᠬᠠᠭᠠᠨ)

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